TOKYO JUPITER MU的自治领域，以东京羽田空港为直径150km的半圆形空间，由外部看类似木星而闻名，内部2300万人的人们皆误以为外部的世界灭亡而生活著，内部比外界时间流动慢6倍，由拥有蓝色血的人类MU密切支配著。 西历2017年东京上空突然出现谜之侵入者，其目的一切不明，之后人类与称之为MU的敌人的超兵器战斗，世界各国的军队均遭到严重的打击，然而在TOKYO JUPITER形成后地球联军与敌方形成胶著状态，直到2027年现在MU的潜在危险仍存在著，地球也持续对抗。.....
旅行中的奇诺和艾尔梅斯来到了一个科学高度发达的文明国家。在安定的环境下，该国家人民均生活在巨蛋之内。一方面，这个国家是由杰出人士们创造出来的“开拓地”，然而另一方面，他们又同时渴望着巨蛋之外真实的阳光和土地。奇诺和艾尔梅斯经过严格的消毒之后进入了巨蛋。在那里，遇到了少女伊莱沙…--世界は美しくなんかない そして それ故に 美しい----The World Is Not Beautiful, Therefore It Is----这个世界并不美丽，然而，又因此而美丽--
